Freenode được quản lý tập trung. Đội ngũ vận hành IRC này có quyền truy cập như nhau đối với tất cả các máy chủ và được phát biểu trên các kênh hỗ trợ (#freenode). Một số hoạt động mà bình thường chỉ áp dụng cho một máy chủ (như k-lines) được lan truyền trên toàn bộ mạng này. Các máy chủ được "tặng" vào mạng, chứ không phải là "liên kết" vào.[5]

Mạng Freenode tập trung vào việc hỗ trợ các dự án theo hướng peer-to-peer và mã nguồn mở.[6] Các kênh không liên quan đến những thứ đó được gọi là off-topic và được khuyến khích tìm một nơi nào khác để hoạt động. Để hỗ trợ cho sự khác biệt này, các kênh được chia thành các không gian tên. Các kênh chính bắt đầu với một dấu #, và các nhóm muốn sử dụng một kênh như vậy phải đăng ký chính thức với freenode. Các kênh "Giới thiệu" bắt đầu bằng hai ##, và có sẵn trên cơ sở ai đến trước thì được phục vụ trước mà không cần phải đăng một nhóm.[7]

Phần mềm máy chủ

Freenode hiện đang chạy trên Atheme IRC Services và IRCD-seven, một tập hợp các bản vá lỗi cho freenode trên IRCD Charybdis (dựa trên ratbox). Năm 1999 freenode chạy trên một IRCD được gọi là dancer (dựa trên IRC-Hybrid) sau đó chuyển sang Hyperion trong năm 2005. Đến năm 2010 Hyperion đã được thay thế bằng IRCD-seven[8][9] vào ngày 30/5/2010.[10]